MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 35929

< Previous12...60616263646566676869707172Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_022521	CT	3	6	1576954	1576959	0 %	50 %	0 %	50 %	549456272
35502	NC_022521	TCC	2	6	1576964	1576969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456272
35503	NC_022521	CCT	3	9	1576977	1576985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456272
35504	NC_022521	CTTGGC	2	12	1577028	1577039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456272
35505	NC_022521	TCT	2	6	1577139	1577144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456272
35506	NC_022521	CAT	2	6	1577184	1577189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456272
35507	NC_022521	TCT	2	6	1577204	1577209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456272
35508	NC_022521	TTC	2	6	1577236	1577241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456272
35509	NC_022521	TTA	2	6	1577255	1577260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456272
35510	NC_022521	CCT	2	6	1577310	1577315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456272
35511	NC_022521	CCAC	2	8	1577318	1577325	25 %	0 %	0 %	75 %	549456272
35512	NC_022521	CCG	3	9	1577333	1577341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456272
35513	NC_022521	GCC	2	6	1577361	1577366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456272
35514	NC_022521	TCCTC	2	10	1577384	1577393	0 %	40 %	0 %	60 %	549456272
35515	NC_022521	GGA	2	6	1577441	1577446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549456272
35516	NC_022521	GGT	2	6	1577513	1577518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549456272
35517	NC_022521	AACGGG	2	12	1577580	1577591	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549456272
35518	NC_022521	CTC	2	6	1577628	1577633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456272
35519	NC_022521	ATCCTC	2	12	1577662	1577673	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549456272
35520	NC_022521	TCA	2	6	1577690	1577695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549456272
35521	NC_022521	CTGG	2	8	1577711	1577718	0 %	25 %	50 %	25 %	549456272
35522	NC_022521	GCC	2	6	1577832	1577837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456272
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35524	NC_022521	TTC	2	6	1577878	1577883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549456272
35525	NC_022521	TA	3	6	1578027	1578032	50 %	50 %	0 %	0 %	549456272
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35534	NC_022521	GTA	2	6	1578417	1578422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549456272
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35536	NC_022521	TA	3	6	1578462	1578467	50 %	50 %	0 %	0 %	549456272
35537	NC_022521	GCCT	2	8	1578470	1578477	0 %	25 %	25 %	50 %	549456272
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35540	NC_022521	CAG	2	6	1578566	1578571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456272
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35543	NC_022521	G	6	6	1578675	1578680	0 %	0 %	100 %	0 %	549456272
35544	NC_022521	C	6	6	1578711	1578716	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35545	NC_022521	G	6	6	1578732	1578737	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35546	NC_022521	TCC	2	6	1578738	1578743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35547	NC_022521	C	6	6	1578742	1578747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35548	NC_022521	TAT	3	9	1578790	1578798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549456273
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35553	NC_022521	ACC	2	6	1579050	1579055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456274
35554	NC_022521	CTC	2	6	1579072	1579077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456274
35555	NC_022521	CTC	2	6	1579088	1579093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456274
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35557	NC_022521	TA	3	6	1579229	1579234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35558	NC_022521	CGG	2	6	1579253	1579258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35559	NC_022521	GGC	2	6	1579279	1579284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549456275
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35563	NC_022521	TCCGC	2	10	1579421	1579430	0 %	20 %	20 %	60 %	549456275
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35591	NC_022521	G	6	6	1580815	1580820	0 %	0 %	100 %	0 %	549456276
35592	NC_022521	GCT	2	6	1580934	1580939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456276
35593	NC_022521	GGCTAT	2	12	1580948	1580959	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549456276
35594	NC_022521	CT	3	6	1581003	1581008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35595	NC_022521	TAA	2	6	1581074	1581079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35596	NC_022521	CTAG	2	8	1581083	1581090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35597	NC_022521	CT	3	6	1581128	1581133	0 %	50 %	0 %	50 %	549456277
35598	NC_022521	CTGG	2	8	1581192	1581199	0 %	25 %	50 %	25 %	549456277
35599	NC_022521	GCA	2	6	1581204	1581209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456277
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35601	NC_022521	CCT	2	6	1581307	1581312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549456277
35602	NC_022521	GAC	2	6	1581370	1581375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549456277
35603	NC_022521	ACC	2	6	1581419	1581424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456277
35604	NC_022521	GCC	2	6	1581425	1581430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549456277
35605	NC_022521	CTG	2	6	1581438	1581443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456277
35606	NC_022521	GCCA	2	8	1581490	1581497	25 %	0 %	25 %	50 %	549456277
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35609	NC_022521	CTCC	2	8	1581585	1581592	0 %	25 %	0 %	75 %	549456277
35610	NC_022521	CTG	2	6	1581599	1581604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549456277
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35615	NC_022521	CCA	2	6	1581844	1581849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549456277
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.